Seit seinem Debüt in der Staatlichen Philharmonie Kaunas im April 2014 arbeitete Martynas Stakionis schon mit Orchestern wie dem Mozarteumorchester Salzburg, den Symphonikern Hamburg, dem Baltic Sea Philharmonic, dem Litauischen Nationalsinfonieorchester, dem Sinfonieorchester der Litauischen Nationaloper und der Kremerata Baltica. In letzten Jahren leitete er die Kremerata Baltica beim Kronberg Festival (Deutschland), beim Sion Festival (Schweiz), beim Bergen International Festival (Norwegen), beim Klavierfestival Ruhr (Deutschland), bei der Dvořakova Praha (Tschechien) sowie auch in den Konzerten in Estland (Tallinner Philharmonie) und Frankreich (Fondation Louis Vuitton). Für das Konzert beim Bergen Festival bekamen Martynas Stakionis, Kremerata Baltica und Geir Draugsvoll von der Norwegischen Kritikervereinigung den Preis für die beste Musik-Aufführung der Saison 2017/2018 mit Sofia Gubaidulinas „Fachwerk“.
Im November 2021 trat Martynas Stakionis an der Litauischen Staatsoper mit Dirigaten von zwei Ballett-Premieren auf. Er war Dirigent und Korrepetitor an der Hamburger Kammeroper in Jahren 2016–2018 mit Dirigaten von sieben verschiedenen Opernproduktionen und 60 Auftritten. Stakionis war musikalischer Assistent und Korrepetitor am Salzburger Landestheater in der Spielzeit 2015/2016. In Juli 2021 assistierte er Laurence Equilbey bei der Wiederaufnahme von LUCIO SILLA in Kooperation mit dem Insula Orchester, Franco Fagioli und Warner Classics.
Unter Martynas Stakionis jüngsten Opernprojekten befinden sich Schrekers FLAMMEN und Puccinis GIANNI SCHICCHI in einer Kooperation zwischen dem Litauischen Staatsorchester und einem Opernprogramm „Opera Accelerator“, dessen Chefdirigent er gerade ist. In der Spielzeit 2022/2023 war Stakionis musikalischer Assistent bei den Opernproduktionen von Janáčeks DAS SCHLAUE FÜCHSLEIN und Bergs LULU am Theater an der Wien.
Aufgewachsen mit vielfältigen Chorerfahrungen, arbeitete Martynas Stakionis bereits mit den Staatlichen Chöre Litauens und Lettlands, dem Mädchenchor Hannover, dem Kinderchor der Pariser Oper, dem Chœur régional Vittoria d’Île-de-France und dem Chor des Lettischen Rundfunks. Seit 2010 hat er Preise bei verschiedenen Chorwettbewerben gewonnen, darunter ein erster Preis beim Jāzeps Vītols 5th International Choral Conductors Competition in Riga (2014) und ein dritter Preis beim Internationalen Romano Gandolfi Wettbewerb für Chorleitung, Parma (2019).
Als begeisterter Neue-Musik-Interpret arbeitete Stakionis zusammen mit den Komponisten Arvo Pärt und Sofia Gubaidulina und dirigierte eine breite Palette ihrer neuesten Partituren. Darunter finden sich Konzerte im Auditorium de la Fondation Louis Vuitton in Paris, bei denen Stakionis die französische Erstaufführung von „Greater Antiphons“ von Arvo Pärt dirigierte.
Seit der Spielzeit 2023/2024 ist Martynas Stakionis am Schleswig-Holsteinischen Landestheater engagiert.
